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chr1	76485270	76486066	505	*	Intron (ENST00000328299.4/256435, intron 3 of 4)	256435	ENST00000464140.1	171357	ST6GALNAC3	mesenchymal stem cell	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0000139,GO:0001574,GO:0001665,GO:0005515,GO:0005654,GO:0006486,GO:0006677,GO:0006687,GO:0008373,GO:0009100,GO:0009311,GO:0016021,GO:0047290,GO:0097503	hsa00604,hsa01100	NA
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chr1	157667985	157670001	344	*	Distal Intergenic	115352	ENST00000468507.1	19889	FCRL3	mesenchymal stem cell	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0002638,GO:0004888,GO:0005887,GO:0007166,GO:0009986,GO:0019900,GO:0019902,GO:0019903,GO:0030890,GO:0034163,GO:0043410,GO:0045577,GO:0050859,GO:0050864,GO:0090279,GO:1905184,GO:1990782	NA	NA
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chr1	176929603	176930530	419	*	Intron (ENST00000367657.7/460, intron 16 of 22)	574441	ENST00000365739.4	98915	MIR488	mesenchymal stem cell	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0032691,GO:0032717,GO:0032720,GO:0035195,GO:0035195,GO:0050728,GO:1903231	NA	NA
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chr1	177128489	177129833	1345	*	Intron (ENST00000367657.7/460, intron 1 of 22)	460	ENST00000424564.2	34850	ASTN1	mesenchymal stem cell	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0001764,GO:0005575,GO:0005768,GO:0007158,GO:0007626,GO:0009897,GO:0016021,GO:0030136,GO:0043204	NA	NA
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chr1	177390844	177391874	351	*	Intron (ENST00000659805.2/102724661, intron 3 of 3)	102724661	ENST00000701603.1	39264	LINC01645	mesenchymal stem cell	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA
chr1	177406751	177407855	548	*	Intron (ENST00000659805.2/102724661, intron 3 of 3)	102724661	ENST00000701603.1	55171	LINC01645	mesenchymal stem cell	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA
chr1	177444174	177444931	758	*	Intron (ENST00000701603.1/102724661, intron 3 of 3)	102724661	ENST00000701603.1	92594	LINC01645	mesenchymal stem cell	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA
chr1	177459256	177460173	406	*	Intron (ENST00000663166.1/ENST00000663166.1, intron 4 of 4)	102724661	ENST00000701603.1	107676	LINC01645	mesenchymal stem cell	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA
chr1	177569186	177570064	596	*	Intron (ENST00000663166.1/ENST00000663166.1, intron 3 of 4)	101928778	ENST00000427173.1	-130460	LINC01741	mesenchymal stem cell	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA
chr1	177674658	177675532	532	*	Intron (ENST00000663166.1/ENST00000663166.1, intron 1 of 4)	101928778	ENST00000427173.1	-24992	LINC01741	mesenchymal stem cell	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA
chr1	177723178	177724667	1490	*	Intron (ENST00000663166.1/ENST00000663166.1, intron 1 of 4)	101928778	ENST00000670282.1	22630	LINC01741	mesenchymal stem cell	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA
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chr1	177780359	177781541	412	*	Intron (ENST00000664407.1/ENST00000664407.1, intron 1 of 6)	101928778	ENST00000670282.1	79811	LINC01741	mesenchymal stem cell	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA
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chr1	177805643	177806178	377	*	Intron (ENST00000664407.1/ENST00000664407.1, intron 1 of 6)	101928778	ENST00000670282.1	105095	LINC01741	mesenchymal stem cell	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA
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chr1	181707663	181708118	347	*	Intron (ENST00000524607.6/777, intron 9 of 11)	777	ENST00000700188.1	-24348	CACNA1E	mesenchymal stem cell	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0005245,GO:0005245,GO:0005509,GO:0005886,GO:0005891,GO:0006816,GO:0007268,GO:0022843,GO:0034765,GO:0045202,GO:0050796,GO:0051899,GO:0070509,GO:0070588	hsa04010,hsa04020,hsa04930	NA
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chr10	116190455	116191172	475	*	Intron (ENST00000369236.5/2674, intron 3 of 8)	2674	ENST00000682724.1	64623	GFRA1	mesenchymal stem cell	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0000165,GO:0005102,GO:0005771,GO:0005794,GO:0005886,GO:0007166,GO:0007399,GO:0007411,GO:0009897,GO:0016167,GO:0019898,GO:0031225,GO:0035860,GO:0038023,GO:0043235,GO:0070062	NA	NA
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chr11	129491954	129493145	345	*	Distal Intergenic	8538	ENST00000281437.6	116106	BARX2	mesenchymal stem cell	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0000122,GO:0000785,GO:0000977,GO:0000977,GO:0000981,GO:0000981,GO:0001228,GO:0001502,GO:0003677,GO:0003682,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005667,GO:0005794,GO:0005829,GO:0006357,GO:0014902,GO:0015629,GO:0045944,GO:1990837	NA	NA
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chr11	129653380	129654142	352	*	Distal Intergenic	101929557	ENST00000631195.1	-36111	LINC01395	mesenchymal stem cell	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA
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chr11	132291598	132292962	456	*	Intron (ENST00000374791.7/50863, intron 4 of 7)	100874281	ENST00000421651.1	7296	NTM-IT	mesenchymal stem cell	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA
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chr11	132399310	132400085	376	*	Distal Intergenic	50863	ENST00000496198.1	66820	NTM	mesenchymal stem cell	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0005515,GO:0005576,GO:0005886,GO:0007155,GO:0008038,GO:0031225	NA	NA
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chr12	130532387	130533420	328	*	Intron (ENST00000690449.1/23504, intron 2 of 22)	23504	ENST00000535703.6	-14470	RIMBP2	mesenchymal stem cell	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0005886,GO:0007274,GO:0010923,GO:0045202	NA	NA
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chr13	53349251	53350982	515	*	Intron (ENST00000657016.1/ENST00000657016.1, intron 2 of 3)	102723875	ENST00000660057.1	-197337	LINC01065	mesenchymal stem cell	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA
chr13	53478022	53479191	294	*	Intron (ENST00000657016.1/ENST00000657016.1, intron 2 of 3)	102723875	ENST00000660057.1	-326108	LINC01065	mesenchymal stem cell	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA
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chr13	60865197	60868154	309	*	Intron (ENST00000658247.1/101926930, intron 3 of 4)	103456507	ENST00000669007.1	-48827	LINC01442	mesenchymal stem cell	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA
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chr15	27136793	27137519	490	*	Intron (ENST00000615808.5/2567, intron 3 of 9)	101928869	ENST00000657653.1	23704	GABRG3-AS1	mesenchymal stem cell	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA
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chr15	31369696	31370222	294	*	Intron (ENST00000307145.4/51621, intron 1 of 1)	51621	ENST00000558844.1	3542	51621	mesenchymal stem cell	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA
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chr15	31454739	31455339	524	*	Distal Intergenic	51621	ENST00000558225.1	61164	51621	mesenchymal stem cell	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA
chr15	33454140	33455295	849	*	Intron (ENST00000415757.7/6263, intron 1 of 102)	6263	ENST00000635875.1	-78027	RYR3	mesenchymal stem cell	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0005219,GO:0005219,GO:0005219,GO:0005509,GO:0005516,GO:0005790,GO:0005886,GO:0006816,GO:0015278,GO:0016021,GO:0016529,GO:0030018,GO:0030659,GO:0033017,GO:0033017,GO:0033017,GO:0034220,GO:0034704,GO:0042383,GO:0048763,GO:0051209,GO:0051289,GO:0070588,GO:0071277,GO:0071286,GO:0071313,GO:0071318,GO:1903779	hsa04020,hsa04371,hsa04713,hsa04921,hsa04970,hsa05010,hsa05012,hsa05020,hsa05022	NA
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chr21	44629661	44632439	581	*	Intron (ENST00000323084.9/54084, intron 1 of 11)	386676	ENST00000397911.5	2568	KRTAP10-9	mesenchymal stem cell	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0005515,GO:0005829,GO:0031424,GO:0045095	NA	NA
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chr21	45776558	45777565	376	*	Intron (ENST00000465077.5/54039, intron 3 of 3)	54039	ENST00000594320.1	27165	PCBP3	mesenchymal stem cell	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0003677,GO:0003723,GO:0003723,GO:0003729,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005737,GO:0005829,GO:0010468,GO:0016071,GO:0051252,GO:0070062	NA	NA
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chr3	10637274	10637926	440	*	Intron (ENST00000646379.1/491, intron 1 of 21)	100874325	ENST00000419591.2	-7967	ATP2B2-IT2	mesenchymal stem cell	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA
chr3	10732657	10733831	792	*	Distal Intergenic	491	ENST00000646379.1	-24650	ATP2B2	mesenchymal stem cell	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0005388,GO:0005388,GO:0005515,GO:0005516,GO:0005524,GO:0005737,GO:0005886,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006816,GO:0006816,GO:0006874,GO:0007605,GO:0019829,GO:0030165,GO:0030182,GO:0034220,GO:0043231,GO:0046872,GO:0051480,GO:0051480,GO:0070062,GO:0070588,GO:0098793,GO:0098839,GO:0098978,GO:0098978,GO:0098982,GO:0098982,GO:0099509,GO:0099566,GO:1903779,GO:1905056,GO:1905059,GO:1905059	hsa04020,hsa04022,hsa04024,hsa04261,hsa04925,hsa04961,hsa04970,hsa04972,hsa04978	NA
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chr3	89032121	89033121	1001	*	Distal Intergenic	2042	ENST00000336596.7	-74500	2042	mesenchymal stem cell	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA
chr3	89153400	89154424	844	*	Intron (ENST00000336596.7/2042, intron 2 of 16)	2042	ENST00000494014.1	45724	2042	mesenchymal stem cell	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA
chr3	89166351	89167082	463	*	Intron (ENST00000336596.7/2042, intron 2 of 16)	2042	ENST00000494014.1	58675	2042	mesenchymal stem cell	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA
chr3	89453694	89454947	567	*	Intron (ENST00000336596.7/2042, intron 15 of 16)	2042	ENST00000494014.1	346018	2042	mesenchymal stem cell	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA
chr3	96532851	96533545	307	*	Distal Intergenic	102465864	ENST00000615894.1	172887	102465864	mesenchymal stem cell	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA
chr3	98269147	98271291	515	*	Intron (ENST00000508616.1/ENST00000508616.1, intron 1 of 3)	79295	ENST00000642105.1	4862	79295	mesenchymal stem cell	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA
chr3	98269147	98271291	684	*	Intron (ENST00000508616.1/ENST00000508616.1, intron 1 of 3)	79295	ENST00000642105.1	4862	79295	mesenchymal stem cell	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA
chr3	99489998	99490999	382	*	Distal Intergenic	105374005	ENST00000484675.1	36114	105374005	mesenchymal stem cell	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA
chr3	106909085	106909791	537	*	Intron (ENST00000660862.1/101929534, intron 6 of 9)	100302640	ENST00000654920.1	211517	LINC00882	mesenchymal stem cell	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA
chr3	106909664	106910391	463	*	Exon (ENST00000666687.1/107986021, exon 8 of 10)	100302640	ENST00000654920.1	210917	LINC00882	mesenchymal stem cell	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA
chr3	107610932	107612677	1746	*	Intron (ENST00000415149.6/56987, intron 2 of 16)	56987	ENST00000406780.5	11619	BBX	mesenchymal stem cell	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0000785,GO:0000977,GO:0000981,GO:0000981,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005829,GO:0006357,GO:0060348,GO:1990837	NA	NA
chr3	111818399	111819455	1057	*	Intron (ENST00000393934.7/257068, intron 3 of 3)	90102	ENST00000412622.5	-39725	PHLDB2	mesenchymal stem cell	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0000226,GO:0005515,GO:0005829,GO:0005886,GO:0005925,GO:0010470,GO:0010717,GO:0031252,GO:0045111,GO:0045180,GO:0045180,GO:0045184,GO:0045296,GO:0051497,GO:0051895,GO:0070507,GO:0070507,GO:1903690,GO:1904261,GO:1904261	NA	NA
chr3	118608668	118609785	591	*	Intron (ENST00000657445.1/105374060, intron 3 of 3)	105374060	ENST00000476460.2	-49541	LOC105374060	mesenchymal stem cell	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA
chr3	118610619	118611439	299	*	Intron (ENST00000657445.1/105374060, intron 3 of 3)	105374060	ENST00000476460.2	-51492	LOC105374060	mesenchymal stem cell	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA
chr3	118740375	118740955	270	*	Intron (ENST00000657445.1/105374060, intron 1 of 3)	105374060	ENST00000657445.1	69802	LOC105374060	mesenchymal stem cell	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA
chr3	121950460	121951416	957	*	Distal Intergenic	6565	ENST00000469422.1	11269	SLC15A2	mesenchymal stem cell	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0005515,GO:0005886,GO:0005886,GO:0005886,GO:0005887,GO:0005887,GO:0006811,GO:0015031,GO:0015333,GO:0015835,GO:0016324,GO:0042908,GO:0042938,GO:0044214,GO:0045087,GO:0070062,GO:0070293,GO:0070424,GO:0071916,GO:0071916,GO:0089717,GO:0140206,GO:0150104,GO:1902600,GO:1990961	NA	NA
chr3	121984162	121984969	808	*	Distal Intergenic	286676	ENST00000460554.2	22332	ILDR1	mesenchymal stem cell	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0005829,GO:0005886,GO:0006897,GO:0016021,GO:0032991,GO:0042802,GO:0061689,GO:0070506,GO:0090277,GO:1990830	NA	NA
chr3	124221220	124221875	449	*	Intron (ENST00000682506.1/8997, intron 1 of 59)	8997	ENST00000354186.8	-6115	KALRN	mesenchymal stem cell	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0004674,GO:0005085,GO:0005524,GO:0005654,GO:0005829,GO:0005829,GO:0006468,GO:0007165,GO:0007186,GO:0007399,GO:0007411,GO:0007417,GO:0007528,GO:0007595,GO:0007613,GO:0008344,GO:0015629,GO:0016192,GO:0035176,GO:0035556,GO:0042711,GO:0043065,GO:0043547,GO:0046872,GO:0046959,GO:0048013,GO:0051056,GO:0060125,GO:0060137,GO:0061003,GO:0070062,GO:0106310,GO:0106311	NA	NA
chr3	125827332	125829356	346	*	Intron (ENST00000641650.1/ENST00000641650.1, intron 1 of 2)	101927056	ENST00000617582.1	32443	LINC02614	mesenchymal stem cell	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA
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chr3	127202637	127203247	319	*	Intron (ENST00000654542.1/ENST00000654542.1, intron 1 of 1)	285311	ENST00000624688.2	9506	C3orf56	mesenchymal stem cell	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0005515	NA	NA
chr3	127241036	127241907	273	*	Exon (ENST00000364418.1/ENST00000364418.1, exon 1 of 1)	100419008	ENST00000465482.3	46139	PRR20G	mesenchymal stem cell	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA
chr3	127244823	127245889	1067	*	Distal Intergenic	100419008	ENST00000465482.3	42157	PRR20G	mesenchymal stem cell	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA
chr3	127245957	127247045	584	*	Distal Intergenic	100419008	ENST00000465482.3	41001	PRR20G	mesenchymal stem cell	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA
chr3	127559413	127561038	743	*	Distal Intergenic	102466199	ENST00000618505.1	14293	MIR6825	mesenchymal stem cell	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA
chr3	127704350	127705248	899	*	Intron (ENST00000453507.7/11343, intron 5 of 6)	11343	ENST00000476682.1	8898	MGLL	mesenchymal stem cell	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0004622,GO:0005515,GO:0005654,GO:0005789,GO:0005829,GO:0005886,GO:0006629,GO:0006633,GO:0006954,GO:0009966,GO:0016020,GO:0016298,GO:0019369,GO:0019433,GO:0019898,GO:0036155,GO:0042803,GO:0046464,GO:0046464,GO:0047372,GO:0047372,GO:0047372,GO:0047372,GO:0050727,GO:0051930,GO:0052651,GO:2000124	hsa00561,hsa01100,hsa04714,hsa04723,hsa04923	NA
chr3	131413232	131413954	268	*	Distal Intergenic	131870	ENST00000502852.1	31447	NUDT16	mesenchymal stem cell	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0000287,GO:0003729,GO:0005525,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005654,GO:0005730,GO:0005737,GO:0006382,GO:0006402,GO:0006402,GO:0006508,GO:0008235,GO:0008284,GO:0016077,GO:0016077,GO:0016311,GO:0030145,GO:0030515,GO:0030515,GO:0031404,GO:0034656,GO:0035863,GO:0035870,GO:0042802,GO:0042803,GO:0046709,GO:0050072,GO:0050072,GO:0050897,GO:0090068,GO:0090502,GO:0098519,GO:0098519,GO:1901639,GO:1901640,GO:1901641,GO:1990003,GO:1990174,GO:1990174,GO:2000233,GO:2000781	hsa00230,hsa01100,hsa03018	NA
chr3	131758013	131759351	1339	*	Intron (ENST00000617767.5/131034, intron 2 of 15)	131034	ENST00000515418.1	-34382	CPNE4	mesenchymal stem cell	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0005515,GO:0005544,GO:0005886,GO:0046872,GO:0070062,GO:0071277	NA	NA
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chr3	131964760	131966593	1442	*	Intron (ENST00000617767.5/131034, intron 1 of 15)	100847040	ENST00000584029.1	19338	MIR5704	mesenchymal stem cell	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA
chr3	132096820	132097831	417	*	Intron (ENST00000512055.5/131034, intron 2 of 19)	131034	ENST00000506687.5	-56570	CPNE4	mesenchymal stem cell	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0005515,GO:0005544,GO:0005886,GO:0046872,GO:0070062,GO:0071277	NA	NA
chr3	132881123	132882133	300	*	Distal Intergenic	66000	ENST00000514529.5	-156258	66000	mesenchymal stem cell	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA
chr3	133099520	133100624	1048	*	Intron (ENST00000514529.5/66000, intron 3 of 3)	66000	ENST00000511555.5	-18712	66000	mesenchymal stem cell	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA
chr3	133792469	133793184	357	*	3 UTR	58477	ENST00000466490.7	8446	58477	mesenchymal stem cell	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA
chr3	134094835	134095652	443	*	Intron (ENST00000484106.3/105374117, intron 4 of 6)	100507210	ENST00000483245.1	-37187	100507210	mesenchymal stem cell	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA
chr3	134124153	134124713	508	*	Intron (ENST00000484106.3/105374117, intron 4 of 6)	6259	ENST00000473208.5	56959	6259	mesenchymal stem cell	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA
chr3	135348516	135348962	387	*	Intron (ENST00000649588.1/102724019, intron 1 of 6)	105374122	ENST00000658465.1	90896	LOC105374122	mesenchymal stem cell	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA
chr3	135956334	135957419	475	*	Distal Intergenic	5523	ENST00000264977.8	-8309	PPP2R3A	mesenchymal stem cell	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0000159,GO:0000159,GO:0000159,GO:0005509,GO:0005515,GO:0006470,GO:0006470,GO:0019888,GO:0043666,GO:0061053	hsa03015,hsa04071,hsa04151,hsa04152,hsa04261,hsa04728,hsa05165	NA
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chr3	137688596	137689616	719	*	Distal Intergenic	8403	ENST00000306087.3	-74699	SOX14	mesenchymal stem cell	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0000122,GO:0000785,GO:0000978,GO:0000981,GO:0000981,GO:0003682,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005634,GO:0005667,GO:0006355,GO:0007399,GO:0007601,GO:0009649,GO:0009653,GO:0030154,GO:0043565,GO:0045892,GO:1990837,GO:2001222	NA	NA
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chr3	185242860	185243850	402	*	Intron (ENST00000231887.8/1962, intron 2 of 6)	1962	ENST00000483104.5	-7398	EHHADH	mesenchymal stem cell	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0003857,GO:0003857,GO:0003857,GO:0003857,GO:0003857,GO:0004165,GO:0004300,GO:0004300,GO:0004300,GO:0005515,GO:0005777,GO:0005777,GO:0005777,GO:0005777,GO:0005782,GO:0005829,GO:0006625,GO:0006635,GO:0006635,GO:0006635,GO:0006635,GO:0016508,GO:0016509,GO:0016863,GO:0019899,GO:0033540	hsa00071,hsa00280,hsa00310,hsa00380,hsa00410,hsa00640,hsa00650,hsa01100,hsa01212,hsa03320,hsa04146	NA
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chr7	150702435	150705585	555	*	Distal Intergenic	100527949	ENST00000464461.1	-11021	GIMAP1-GIMAP5	mesenchymal stem cell	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA
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chr8	10498491	10499547	399	*	Intron (ENST00000523024.1/ENST00000523024.1, intron 1 of 4)	101929191	ENST00000668412.1	18955	LINC03022	mesenchymal stem cell	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA
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